MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae) chromosome

Total Repeats: 14963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004545	TTA	2	6	494	499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
2	NC_004545	TAG	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904514
3	NC_004545	A	10	10	553	562	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
4	NC_004545	GGA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27904514
5	NC_004545	AAG	2	6	650	655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904514
6	NC_004545	TTCAG	2	10	704	713	20 %	40 %	20 %	20 %	27904514
7	NC_004545	A	6	6	727	732	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
8	NC_004545	A	6	6	792	797	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
9	NC_004545	TAT	2	6	803	808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
10	NC_004545	GAT	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904514
11	NC_004545	AAT	2	6	870	875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
12	NC_004545	CAAA	2	8	889	896	75 %	0 %	0 %	25 %	27904514
13	NC_004545	T	7	7	904	910	0 %	100 %	0 %	0 %	27904514
14	NC_004545	TGT	2	6	918	923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904514
15	NC_004545	AGG	2	6	945	950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27904514
16	NC_004545	TA	3	6	958	963	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
17	NC_004545	T	6	6	975	980	0 %	100 %	0 %	0 %	27904514
18	NC_004545	AGG	2	6	981	986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27904514
19	NC_004545	C	7	7	1072	1078	0 %	0 %	0 %	100 %	27904514
20	NC_004545	TAA	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
21	NC_004545	A	6	6	1214	1219	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
22	NC_004545	A	6	6	1236	1241	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
23	NC_004545	A	7	7	1246	1252	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
24	NC_004545	TATT	2	8	1257	1264	25 %	75 %	0 %	0 %	27904514
25	NC_004545	TAA	2	6	1271	1276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
26	NC_004545	AT	3	6	1387	1392	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
27	NC_004545	AACT	2	8	1529	1536	50 %	25 %	0 %	25 %	27904514
28	NC_004545	AAGT	2	8	1542	1549	50 %	25 %	25 %	0 %	27904514
29	NC_004545	T	9	9	1560	1568	0 %	100 %	0 %	0 %	27904514
30	NC_004545	AAAT	2	8	1577	1584	75 %	25 %	0 %	0 %	27904514
31	NC_004545	TAC	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904514
32	NC_004545	GAA	2	6	1600	1605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904514
33	NC_004545	GCT	3	9	1606	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27904514
34	NC_004545	TTA	2	6	1621	1626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
35	NC_004545	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
36	NC_004545	GGT	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27904514
37	NC_004545	TGA	2	6	1710	1715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904514
38	NC_004545	AAC	2	6	1896	1901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27904514
39	NC_004545	TA	3	6	1934	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
40	NC_004545	AAT	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
41	NC_004545	AAAT	2	8	1973	1980	75 %	25 %	0 %	0 %	27904514
42	NC_004545	TTA	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
43	NC_004545	AAAT	2	8	2018	2025	75 %	25 %	0 %	0 %	27904514
44	NC_004545	TACTC	2	10	2026	2035	20 %	40 %	0 %	40 %	27904514
45	NC_004545	A	6	6	2047	2052	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
46	NC_004545	AAG	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904514
47	NC_004545	A	6	6	2145	2150	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
48	NC_004545	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
49	NC_004545	TAT	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
50	NC_004545	TAAAA	2	10	2181	2190	80 %	20 %	0 %	0 %	27904514
51	NC_004545	A	6	6	2187	2192	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
52	NC_004545	AGT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904514
53	NC_004545	AT	3	6	2317	2322	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
54	NC_004545	A	10	10	2325	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
55	NC_004545	TA	3	6	2336	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
56	NC_004545	ATC	3	9	2708	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904515
57	NC_004545	TCA	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904515
58	NC_004545	T	7	7	2810	2816	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
59	NC_004545	T	6	6	2851	2856	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
60	NC_004545	TACAA	2	10	2874	2883	60 %	20 %	0 %	20 %	27904515
61	NC_004545	CAAA	2	8	2888	2895	75 %	0 %	0 %	25 %	27904515
62	NC_004545	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904515
63	NC_004545	TAA	3	9	2931	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904515
64	NC_004545	A	6	6	2961	2966	100 %	0 %	0 %	0 %	27904515
65	NC_004545	TTTG	2	8	2998	3005	0 %	75 %	25 %	0 %	27904515
66	NC_004545	T	7	7	3008	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
67	NC_004545	ATTT	2	8	3054	3061	25 %	75 %	0 %	0 %	27904515
68	NC_004545	AATTA	2	10	3090	3099	60 %	40 %	0 %	0 %	27904515
69	NC_004545	TAA	2	6	3155	3160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904515
70	NC_004545	T	6	6	3161	3166	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
71	NC_004545	T	6	6	3238	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
72	NC_004545	TTA	2	6	3274	3279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904515
73	NC_004545	ATT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904515
74	NC_004545	ATT	2	6	3357	3362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904515
75	NC_004545	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27904515
76	NC_004545	TAA	2	6	3416	3421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904515
77	NC_004545	TTTTAT	2	12	3435	3446	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904515
78	NC_004545	TGT	2	6	3567	3572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904516
79	NC_004545	AGC	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27904516
80	NC_004545	AGC	2	6	3613	3618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27904516
81	NC_004545	CA	3	6	3694	3699	50 %	0 %	0 %	50 %	27904516
82	NC_004545	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	27904516
83	NC_004545	TA	3	6	3759	3764	50 %	50 %	0 %	0 %	27904516
84	NC_004545	TA	3	6	3778	3783	50 %	50 %	0 %	0 %	27904516
85	NC_004545	TTG	2	6	3928	3933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904517
86	NC_004545	A	6	6	4059	4064	100 %	0 %	0 %	0 %	27904517
87	NC_004545	AAATTA	2	12	4099	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904517
88	NC_004545	A	9	9	4112	4120	100 %	0 %	0 %	0 %	27904517
89	NC_004545	ATA	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904517
90	NC_004545	ACA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27904517
91	NC_004545	A	6	6	4153	4158	100 %	0 %	0 %	0 %	27904517
92	NC_004545	GAAAAA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27904517
93	NC_004545	AGCA	2	8	4216	4223	50 %	0 %	25 %	25 %	27904517
94	NC_004545	ATA	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904517
95	NC_004545	AGA	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904517
96	NC_004545	A	8	8	4367	4374	100 %	0 %	0 %	0 %	27904517
97	NC_004545	AT	3	6	4504	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	27904518
98	NC_004545	AAT	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904518
99	NC_004545	ATT	2	6	4521	4526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904518
100	NC_004545	AATTT	2	10	4530	4539	40 %	60 %	0 %	0 %	27904518
101	NC_004545	TTTA	2	8	4571	4578	25 %	75 %	0 %	0 %	27904518
102	NC_004545	TGT	2	6	4587	4592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904518
103	NC_004545	AATT	2	8	4613	4620	50 %	50 %	0 %	0 %	27904518
104	NC_004545	AAAC	2	8	4640	4647	75 %	0 %	0 %	25 %	27904518
105	NC_004545	TA	3	6	4669	4674	50 %	50 %	0 %	0 %	27904518
106	NC_004545	AGT	2	6	4709	4714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904518
107	NC_004545	CA	3	6	4735	4740	50 %	0 %	0 %	50 %	27904518
108	NC_004545	TGAA	2	8	4744	4751	50 %	25 %	25 %	0 %	27904518
109	NC_004545	AT	3	6	4754	4759	50 %	50 %	0 %	0 %	27904518
110	NC_004545	A	7	7	4781	4787	100 %	0 %	0 %	0 %	27904518
111	NC_004545	A	7	7	4797	4803	100 %	0 %	0 %	0 %	27904518
112	NC_004545	GGT	2	6	4839	4844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27904518
113	NC_004545	TTA	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904518
114	NC_004545	CATT	2	8	4883	4890	25 %	50 %	0 %	25 %	27904518
115	NC_004545	ATT	2	6	4904	4909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904518
116	NC_004545	ATA	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904519
117	NC_004545	TAA	2	6	4973	4978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904519
118	NC_004545	GAAG	2	8	5023	5030	50 %	0 %	50 %	0 %	27904519
119	NC_004545	GTA	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904519
120	NC_004545	ATA	2	6	5203	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904519
121	NC_004545	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904519
122	NC_004545	AAAT	2	8	5330	5337	75 %	25 %	0 %	0 %	27904519
123	NC_004545	A	6	6	5360	5365	100 %	0 %	0 %	0 %	27904519
124	NC_004545	AATT	2	8	5435	5442	50 %	50 %	0 %	0 %	27904519
125	NC_004545	ATT	2	6	5488	5493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904519
126	NC_004545	AGA	2	6	5577	5582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904519
127	NC_004545	AATTGT	2	12	5604	5615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904519
128	NC_004545	TGCTTC	2	12	5616	5627	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	27904519
129	NC_004545	CAG	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27904519
130	NC_004545	T	6	6	5683	5688	0 %	100 %	0 %	0 %	27904519
131	NC_004545	AAGGA	2	10	5696	5705	60 %	0 %	40 %	0 %	27904519
132	NC_004545	ATG	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904519
133	NC_004545	TAT	2	6	5765	5770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904519
134	NC_004545	CCT	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27904519
135	NC_004545	T	6	6	5810	5815	0 %	100 %	0 %	0 %	27904519
136	NC_004545	ATT	2	6	5829	5834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904519
137	NC_004545	ATT	2	6	5861	5866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904519
138	NC_004545	A	6	6	5868	5873	100 %	0 %	0 %	0 %	27904519
139	NC_004545	TAAA	2	8	5888	5895	75 %	25 %	0 %	0 %	27904519
140	NC_004545	ATT	2	6	5926	5931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904519
141	NC_004545	CTA	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904519
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269	NC_004545	T	7	7	10627	10633	0 %	100 %	0 %	0 %	27904523
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410	NC_004545	TA	3	6	15523	15528	50 %	50 %	0 %	0 %	27904528
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